Nie jejkuj.
Zrób to zgłoszenie - tak jak pisałem wyżej.
Teoretycznie stracisz kilkaset złotych, ale ugrać możesz swoją przyszłość.
Od zgłoszenia urząd będzie miał 30 dni na wniesienie (ewentualnej) decyzji odmownej.
Jak taka decyzja będzie, to masz drogę odwoławczą aż do NSA.
Urząd o tym doskonale wie - tak więc zanim wyda decyzje odwoławczą dobrze przeanalizuje konkretną sytuację.
Moim zdaniem - urząd nie ma podstaw do wniesienia odwołania, na zgłoszone prace związane z przebudową (o takim jak pisałeś zakresie robót).
I jeszcze zapytanie wyjaśniające - decyzja sądu dotyczyła podziału, czy wyodrębnienia ?