Impregnacja nie zabezpiecza przed przeciekami, a nieszczelności mogą występować nie przy samym kominie. Ustalenie przyczyny może być trudne i zależy od sposobu pokrycia dachu. Z opisu wynika, że nieszczelność jest niewielka i dopiero po długotrwałych opadach pojawiają się przecieki, co sugeruje, że może gdzieś się gromadzić zanim przeniknie do środka. Pomijajając nieszczelności obróbki wokół komina, trzeba też brać pod uwagę spływ wody po FWK (jeśli taka była ułożona) przenikającej przez pokrycie, kalenicę . Woda natrafia na przeszkdę w postaci komina i przecieka po jego powierzchni.